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砷（As）是一种类似金属的有毒元素，广泛分布于世界各地。为了了解环境中砷代谢的微生物群落，我们开发了一个精心策划的砷功能基因数据库（AsgeneDB），涵盖了五个砷代谢途径（转运、呼吸、还原、氧化和甲基化过程）、59个砷生物转化功能基因家族和414773个代表性序列。在这里，我们从多个公共数据库中收集了As基因家族的蛋白质序列，如UniProt、NCBI RefSeq、KEGG、COG、eggNOG、arCOG和KOG。AsgeneDB涵盖了46个门和1653个属的细菌、古菌和真菌。通过整合多个线性同源数据库，AsgeneDB具有高度的特异性、全面性、代表性和准确性，可以快速分析微生物群落的砷代谢和转化功能。AsgeneDB和相关R包将极大地推动各种环境中微生物群落砷代谢的研究。

文件一： AsgeneDB.fa：以fasta格式存储的代表序列，通过对经过整理的序列进行100%序列一致性聚类获得。此文件可用于在宏基因组中通过“BLAST”搜索砷基因。

文件二： asgene.map：一个映射文件，用于将序列ID映射到基因名称，仅包含属于砷基因家族的序列。此文件用于从与数据库进行BLAST类似搜索的结果中生成砷基因谱。

文件三： id_gene_tax_pathway_total.csv：AsgeneDB中序列的物种表。

文件四： length.txt：该文件包含AsgeneDB中氨基酸序列的长度，用于标准化砷基因丰度统计。

/TJPROJ7/META_ASS/16s/yaoyuanyuan/personalscript/micro/software/Asgene_DB

输出结果一：

输出结果二：