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filter.snp.vcf.gz_.filter.indel.vcf.gz这两个文件过滤的标准

*.filter.snp.vcf.gz使用GATK的VariantFiltration工具过滤(参数:QD < 2.0 || FS > 60.0 || MQ < 30.0 || HaplotypeScore > 13.0 || MappingQualityRankSum < -12.5 || ReadPosRankSum < -8.0);*.filter.indel.vcf.gz也使用GATK的VariantFiltration工具过滤(参数:QD < 2.0 || FS > 200.0 || ReadPosRankSum < -20.0)

filter.snp.vcf.gz_.filter.indel.vcf.gz这两个文件过滤的标准.txt · 最后更改: 2023/06/16 02:50 由 mengyanliang