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gsea多条通路图绘制

脚本

/TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/zhangxin/miniconda/envs/R_3.6.0/bin/Rscript /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/sunjiaxue/scripts/GSEA_Rscript --rnk readcount_1.rnk --gmt gene_sets.gmt --term_id terms.txt  --outfile /TJPROJ6/RNA_SH/personal_dir/sunjiaxue/test_20231220/tt/edb/ttrr

#结果
outfile文件夹中保存p值前十的单个通路图,新建的more_term文件夹保存多通路图,文件名按照输入顺序命名。

#terms.txt文件格式:
GO:0070013|GO:0005654|GO:0046483
GO:0070013|GO:0005654|GO:0046483
gsea多条通路图绘制.txt · 最后更改: 2024/01/12 08:03 由 sunjiaxue