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nc全关联分析

测试

脚本路径:

/TJPROJ6/RNA_SH/script_dir/wts_pipeline
/TJPROJ6/RNA_SH/script_dir/wts_pipeline.bak (备份)

测试路径:

/TJPROJ6/RNA_SH/script_dir/wts_ce_test

流程修改日志


测试准备

准备文件:

  • small结果文件
  • lnc结果文件
  • lnc分析的records.tar.gz
  • circ结果文件(如果lnc中分析了circ就不需要)

刷流程脚本

  • start.sh (已测试√)
python /TJPROJ6/RNA_SH/script_dir/wts_pipeline/asso_v2.6.py -l lnc_circ_Result-X101SC22052185-Z01-F002-B1-35.20220530.zip -s small_Result-X101SC22052185-Z01-F001-B1-35.zip -r records.tar.gz

跑流程

  • run.sh (已测试√)
python /TJPROJ6/RNA_SH/script_dir/wts_pipeline/WTS2_vs_ce_2.6.py --lnc_dir /TJPROJ6/RNA_SH/script_dir/wts_ce_test/raw/l/ --miRNA_dir /TJPROJ6/RNA_SH/script_dir/wts_ce_test/raw/s/*result/
  • ce_wts_analysis.sh & (已测试√)
nohup sh ce_wts_analysis.sh &
nc全关联分析.txt · 最后更改: 2022/06/16 06:01 由 wangjun