简介

建库测序数据需要进行排污处理，由于之前开发时只针对动植物的数据，NT数据库中缺乏微生物部分的数据，会造成排污遗漏，影响数据的准确性，为优化这一问题，现在更新使用NT全库进行比对。

功能

NT排污

1. 数据库路径：

/TJNAS01/AFS_RESEQ/Share/NT_db/nt

示例脚本：

/TJNAS01/AFS_RESEQ/Users/hongxiang/Afs_pipeline/ngsreseq_afs_pipeline_v1.py NT_mapping \
	--samplelist ./samplelist \
	--outdir ./