RSD（Relative SNP/SNV Density）分析是一种针对个体样本的 SNP 差异分析手段，可 用于筛选个体特异的选择区段。

1）基因型文件：包含且仅包含用于 RSD 分析的所有样品基因型信息，无头行，标准 基因型文件格式（前三列分别为：染色体、位置、Ref；随后为样品基因型；列之间以 tab 分隔）。 2）sample 文件：包含样品名称，单列，顺序需与基因型文件顺序一致。 3）cfg 文件：其中包含参考基因组 fai 文件，主要提供染色体长度信息；RSD 分析脚 本。请注意保证 cfg 文件“=”前的名称不变，只需要根据自己的需求修改 fai 文件的绝对路 径 和 名 称 。

脚本示例 ： /TJNAS01/AFS_RESEQ/Proj/liangjifeng/QunTiJinHua_afssale/RSD_RelativeSNPSNVDensity/rsd_major.sh

python   /TJPROJ6/CCX/Share/PopEvolution/RSD/00.bin/RSD_pipline.V1.py    \
    --input    /TJNAS01/AFS_RESEQ/Proj/liangjifeng/QunTiJinHua_afssale/RSD_RelativeSNPSNVDensity/geneytpe_example   \
    --cfg      /TJNAS01/AFS_RESEQ/Proj/liangjifeng/QunTiJinHua_afssale/RSD_RelativeSNPSNVDensity/Config    \
    --sample   /TJNAS01/AFS_RESEQ/Proj/liangjifeng/QunTiJinHua_afssale/RSD_RelativeSNPSNVDensity/sample_example  \
    --win 10000   \
    --cutoff 10    \
    --shuffle 100000    \
    --name ninanjie

# 针对个体样本的 SNP 差异分析手段，可用于筛选个体特异的选择区段
# --input