癌症的肿瘤纯度和倍性分析，使用sequenza软件输入成对bam文件进行自动分析

标准输出结果和组图

1. 配置文件以及环境：

一个三列的文件： 样本名  N_bam  T_bam
例如： /TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/liangjifeng/software/jiftools/sequenza/example2_pipeline/sequenza_config
加载环境 
export PATH=/TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/liangjifeng/software/miniconda3/envs/R41/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/liangjifeng/software/miniconda3/envs/R41/lib:$LD_LIBRARY_PATH

示例脚本：

sh  /TJPROJ6/AFS_RESEQ/Proj/liangjifeng/software/jiftools/sequenza/run.sh     配置文件绝对路径     输出路径