描述 | 分类 |
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swissprot注释解释 | 注释 |
Cytoband格式解释 | Cytoband格式 |
snpeff注释突变影响的预测 | 影响等级解读 |
0.SuppFiles/circRNA_description.xls解读 | feature列的来源 |
kegg通路图含义 | KEGG解释 |
甲基化转录组联合分析Expression中的none、low、medium、high | 联合分析中.Whole_Associate/1.2.Gene_Line_plot/1.2.1.Gene_Line_Expre_plot/Guy11解读 |
small项目中原始数据中没有5’接头序列 | small项目QC |
为什么动物small项目中分析基因3utr与mirna的靶向关系 | small靶基因预测 |
GSEA结果解读 | GSEA富集 |
edgeR无生物学重复bcv设置 | 差异分析 |
甲基化结果文件6.compare_DM_Analysis中文件来源解读 | 甲基化结果文件解读 |
hisat2 | 转录有参医口流程 |
序列中大小写碱基代表的含义 | 有参、原核、NC |
差异分析中padj和pvalue为NA | 差异分析DESeq2 |
甲基化联合分析韦恩结果中overlap.anno.xls与DMR.DEG.anno.xls区别 | 其中overlap.anno.xls是各比较组合转录组差异基因(这个是使用的差异数据中的比较组_deg_all表格)与DMR相关基因交叠基因注释列表;另一个anno是使用的转录deg表格与DMR相关基因交叠基因注释列表。 |
RNAseq 文库类型与软件对应关系 | RNAseq 文库类型与软件对应关系 |
有参医口QC部分align_region计数 | 有参医口QC部分align_region计数 |
全转关联分析中small与mRNA靶向结果比small项目中的结果多 | small与mRNA靶基因结果不一致 |
gtf中gene_biotype和transcript_biotype的含义 | gtf和gff中biotype解读 |
女性样本中Y染色体有reads mapping | 女性样本中Y染色体有reads mapping |
无参SNP结果解读 | 无参SNP结果中0/1:117解读 |
参考基因组中toplevel sm rm 的区别 | 参考基因组中toplevel sm rm 的区别 |
碱基符号 | 碱基序列 |
chip比较组合结果中venn图 | 当组内有生物学重复时结果如何 |
动植物small靶基因预测软件结果差异较大 | psRobot(植物)、miranda(动物)、RNAhybrid(动物) |
kegg通路展示方框错位 | src中通路图 |
非指定参考基因组是否能够注释到已知circ | circ注释 |
GO注释中go编号在最新的数据库中找不到 | go注释 |
diffband输出文件解读 | chip差异peak分析 |
NCBI中GeneID和LocusTag的关系文件 | NCBI中gene的info信息 |
ensemble选择对应版本的数据库 | ensemble数据版本选择 |