售后流程优化
售后流程优化
| 序号 | 适用产品 | 分析名称 | 分析内容 | 评估须知 | 开发时间 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 有参 | 产品：mapman功能富集 | 功能富集分析 | 2022/09/01 | 示例 | |
| 2 | 医口 | ercc矫正并差异分析 | 差异分析 | 2022/09/01 | 示例 | |
| 3 | 所有 | bigWigMerge合并bigwig文件 | 文件合并 | 20220926 | 示例 | |
| 4 | 有参 | ssGSEA&GSVA | ssGSEA&GSVA | 20220926 | ||
| 5 | 有参 | 整理AS结果用于绘图 | 文本整理 | 20220926 | ||
| 6 | 有参 | MA_plot | 绘图 | 20220926 | ||
| 7 | lncRNA | 整理 | 富集结果整理 | 20220927 | ||
| 8 | 所有 | 填写project.txt | 样本名称;分组;比较组合;venn;coexpr_venn填写 | 20220927 | ||
| 9 | 有参 | PPI分析 | 在ppi结果中添加ppi_name | 20220927 | ||
| 10 | 有参 | 转录富集分析 | 整理转录本富集分析的go.xls,kegg.xls | 20220927 | ||
| 11 | 有参 | SNP分析 | SNP中vcf文件转maf文件 | 20220831 | ||
| 12 | 有参 | logo绘制 | 样品各碱基占比绘制logo图 | 20220831 | ||
| 13 | NC | asso | mRNA和miRNA关联分析 | 20220831 | ||
| 14 | 甲基化 | 计算gene内甲基化水平 | 根据cx_report和bed文件计算gene内甲基化水平 | 20220930 | ||
| 15 | 有参 | TMB肿瘤突变负荷分析 | 结合TCGA数据库中某个癌症数据进行TMB肿瘤突变负荷分析 | 20221230 | ||
| 16 | 有参 | MSI微卫星不稳定性 | 结合TCGA数据库中某个癌症数据进行MSI微卫星不稳分析 | 20221230 | ||
| 17 | chip | 峰图绘制 | 绘制reads_across_gene图 | 20230513 | ||
| 18 | WGBS | methylKit差异DMR分析 | 使用methylKit软件进行DMR分析 | 20230513 | ||
| 19 | 所有 | ResFinder耐药基因数据库注释 | ResFinder耐药基因数据库注释 | 20230912 | ||
| 20 | WGBS | 统计bam中指定深度位点个数及占比 | 统计bam中指定深度位点个数及占比 | 20230829 | ||
| 21 | WGBS | 对甲基化位点进行区域注释 | 对甲基化位点进行区域注释 | 20230829 | ||
| 22 | 有参 | 对样本进行tsne、umap、pca、pcoa、nmds、plsda、oplsda分析 | 对样本进行tsne、umap、pca、pcoa、nmds、plsda、oplsda分析 | 20230912 | ||
| 23 | 有参 | 引物定位及定量 | 对老师给定的引物定位出其扩增位置，对该位置进行定量 | 20231107 | ||
| 24 | 有参 | 可变剪切 | 单样本可变剪切 | 20231108 | ||
| 25 | lnc | lnc分类 | 20231230 | |||
| 26 | chip | motif定位 | 20231230 | |||
| 27 | 有参 | hallmark gsea分析 | 20231230 | |||
| 28 | 无参 | gsea分析 | 20240112 | |||
| 29 | 有参、无参 | gsea多条通路图绘制 | 20240112 | |||
| 30 | 有参 | CDS.fa密码子频率统计 | 20240131 | |||
| 31 | 有参 | 模式生物，多组别富集分析 | 20240508 | |||
| 32 | 有参 | 山峦图 | 20240905 | |||
售后流程优化.txt · 最后更改: 2024/09/05 09:23 由 sunjiaxue
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